About the Authors

Sylvie Miquel

Contributed equally to this work with: Sylvie Miquel, Eric Peyretaillade, Laurent Claret

Affiliations Clermont Université, Université d'Auvergne, JE2526, INRA, USC-2018, Clermont-Ferrand, France, Institut Universitaire de Technologie, Université d'Auvergne, Aubière, France

Eric Peyretaillade

Contributed equally to this work with: Sylvie Miquel, Eric Peyretaillade, Laurent Claret

Affiliations Institut Universitaire de Technologie, Université d'Auvergne, Aubière, France, Laboratoire: Microorganismes Génome et Environnement, Université Clermont 2, CNRS, UMR 6023, Aubière, France

Laurent Claret

Contributed equally to this work with: Sylvie Miquel, Eric Peyretaillade, Laurent Claret

Affiliations Clermont Université, Université d'Auvergne, JE2526, INRA, USC-2018, Clermont-Ferrand, France, Institut Universitaire de Technologie, Université d'Auvergne, Aubière, France

Amélie de Vallée

Affiliations Clermont Université, Université d'Auvergne, JE2526, INRA, USC-2018, Clermont-Ferrand, France, Institut Universitaire de Technologie, Université d'Auvergne, Aubière, France

Carole Dossat

Affiliation Commissariat à l'Energie Atomique (CEA), Direction des Sciences du Vivant, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, France

Benoit Vacherie

Affiliation Commissariat à l'Energie Atomique (CEA), Direction des Sciences du Vivant, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, France

El Hajji Zineb

Affiliation Commissariat à l'Energie Atomique (CEA), Direction des Sciences du Vivant, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, France

Beatrice Segurens

Affiliation Commissariat à l'Energie Atomique (CEA), Direction des Sciences du Vivant, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, France

Valerie Barbe

Affiliation Commissariat à l'Energie Atomique (CEA), Direction des Sciences du Vivant, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, France

Pierre Sauvanet

Affiliations Clermont Université, Université d'Auvergne, JE2526, INRA, USC-2018, Clermont-Ferrand, France, Centre Hospitalier Universitaire, Pôle digestif, Clermont-Ferrand, France

Christel Neut

Affiliation INSERM U995, Lille, France

Jean-Frédéric Colombel

Affiliation INSERM U995, Lille, France

Claudine Medigue

Affiliations Commissariat à l'Energie Atomique (CEA), Direction des Sciences du Vivant, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, France, CNRS-UMR 8030, Laboratoire d'Analyse Bioinformatique en Génomique et Métabolisme, Evry, France

Francisco J. M. Mojica

Affiliation Departamento de Fisiología, Genética y Microbiología, Universidad de Alicante, Alicante, Spain

Pierre Peyret

Affiliations Institut Universitaire de Technologie, Université d'Auvergne, Aubière, France, Laboratoire: Microorganismes Génome et Environnement, Université Clermont 2, CNRS, UMR 6023, Aubière, France

Richard Bonnet

Affiliations Clermont Université, Université d'Auvergne, JE2526, INRA, USC-2018, Clermont-Ferrand, France, Centre Hospitalier Universitaire, Bactériologie, Clermont-Ferrand, France

Arlette Darfeuille-Michaud

arlette.darfeuille-michaud@u-clermont1.fr

Affiliations Clermont Université, Université d'Auvergne, JE2526, INRA, USC-2018, Clermont-Ferrand, France, Institut Universitaire de Technologie, Université d'Auvergne, Aubière, France

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

Conceived and designed the experiments: SM EP LC CD BV EHZ BS VB CN JFC PP ADM. Performed the experiments: SM EP LC AdV CD BV EHZ BS VB PS. Analyzed the data: SM EP LC AdV CD BV EHZ BS VB PS CM FJMM RB ADM. Contributed reagents/materials/analysis tools: CN JFC CM. Wrote the paper: SM EP LC CM ADM.